La colección ornitológica del Museo de Zoología representa una valiosa infraestructura universitaria, que es una de las colecciones más importantes de la UNAM, de México y de Latinoamérica. Es ampliamente consultada por estudiantes e investigadores de México y el extranjero.

Desarrollamos proyectos de investigación están centrados en Biología Evolutiva y son enfocados hacia el estudio sistemático, biogeográfico, ecológico y de conservación de la fauna mexicana y mesoamericana. Alrededor de estos temas, realizamos una gran variedad de trabajos que también involucran aspectos de manejo de colecciones, museología, biología comparada teórica y práctica. 

Los temas y metodologías son variados, desde estudios básicos de taxonomía alfa, variación geográfica, límites de especies, filogeografía, filogenia, sistemática fenética y sistemática cladística y ecología evolutiva. 

Nos interesa el estudio de la filogeografía y la genómica evolutiva, con base en secuenciación de nueva generación, a través del acceso un laboratorio de sistemática molecular compartido. La Biogeografía es uno de los ejes principales alrededor del que se diseñan los proyectos.

Además, incorporamos el análisis bioacústico y de evolución de la coloración aplicado a la sistemática, lo que provee de interesante información evolutiva y ecológica a nuestra investigación.

Las bases de datos de las colecciones se encuentran disponibles en línea a través de varios portales de consulta distribuida de bases de datos, especialmente a través de la Unidad de Informática para la Biodiversidad de la Facultad de Ciencias (UniCiencias) y el repositorio nacional de CONACyT. Los datos son de libre acceso. Sin embargo, es responsabilidad de los usuarios el solicitar por escrito la autorización de los curadores para el uso de los datos en publicaciones o en actividades no lucrativas, además de hacer explícitos los créditos pertinentes a la institución proveedora de los datos.